Library preparation for RNA-seq

Library preparation for RNA-seq
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La tecnologia D-Plex è l’ultima innovazione di Diagenode nel sequenziamento dell’RNA. Questo metodo ultrasensibile privo di legatura utilizza la cattura e l’amplificazione innovative mediante tailing & switching per la preparazione di librerie di DNA da quantità di input estremamente basse, fino a 10 pg per smallRNA (‹200 nt) o RNA circolante e 100 pg per RNA totale.

Questa tecnologia offre una nuova soluzione di sequenziamento dell’RNA, ottimizzata e specificamente formattata sia per i sequenziatori DNBSEQ^TM di MGI sia per i sequenziatori Illumina.

L’utilizzo della tecnologia D-Plex per il sequenziamento dell’RNA è ottimale per lo studio dell’RNA non codificante che regola l’espressione genica a livello trascrizionale e post-trascrizionale. Consente il rilevamento diverso e innovativo dei trascritti, garantendo una rappresentazione realistica del trascrittoma con bias ridotti al minimo.

Questa nuova soluzione è stata ampiamente convalidata per la biopsia liquida, ad esempio dal plasma umano, e campioni FFPE rendendola uno strumento importante per studi clinicamente rilevanti.

Perché la nuova tecnologia D-Plex avvantaggia la ricerca sull’RNA?

Metodo innovativo e senza legatura ultrasensibile per la preparazione delle librerie per il sequenziamento dell’RNA
Capacità di input ultra bassa, fino a 10 pg per smallRNA (‹200 nt) o RNA circolante e 100 pg per RNA totali
Elevata complessità della libreria che fornisce un rilevamento delle trascrizioni diverso e innovativo
Migliora l’accuratezza di quantificazione attraverso l’utilizzo di UMI
Prestazioni ottimali su campioni clinici, come biopsie liquide
Facile da usare con un tempo pratico minimo: un giorno, protocollo una provetta
Compatibile con le piattaforme di sequencing di Illumina e MGI

UMI consente l’identificazione accurata dei duplicati per campioni a basso input

La tecnologia D-Plex per il sequenziamento Illumina integra identificatori molecolari univoci (UMI) in ogni trascrizione incorporata nella libreria finale. L’uso di tale tag molecolare offre la possibilità di escludere i duplicati della PCR da un insieme di letture durante l’analisi dei dati di sequenziamento, migliorando così la quantificazione dell’espressione del trascritto.

Maggiori informazioni sulla Tecnologia D-Plex

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Prodotti

Illumina Sequencing Platform

Code	Description	Format
C05030033	D-Plex mRNA-seq Kit for Illumina Product Features An innovative technology with template switching and UMIs Ultra-sensitive methodology with low input capability down to 10 ng High ef…	24 rxns
C05030010	D-Plex Single Indexes for Illumina – Set A D-Plex Single Indexes Module – Set A includes PCR primers with 24 barcodes (i7 index) for library multiplexing with the D-Plex Small…	24 rxns
C05030011	D-Plex Single Indexes for Illumina – Set B D-Plex Single Indexes Module – Set B includes PCR primers with 24 barcodes (i7 index) for library multiplexing with the D-Plex …	24 rxns
C05030001	D-Plex Small RNA-seq Kit for Illumina Product Features Ultra-low input capability, down to 10 pg for small RNAs or circulating RNAs Higher library complexity providing novel and diverse tra…	24 rxns
C05030031	D-Plex Total RNA-seq Kit for Illumina Product Features An innovative technology with template switching and UMIs Ultra-low input capability, down to 50 pg for total RNAs Capture the widest…	24 rxns
C05030021	D-Plex Unique Dual Indexes for Illumina – Set A D-Plex Unique Dual Indexes Module – Set A includes primer pairs with 24 unique dual barcodes (unique i5 and i7 indexes) for library multiplexi…	24 rxns
C05030022	D-Plex Unique Dual Indexes for Illumina – Set B D-Plex Unique Dual Indexes Module – Set B includes primer pairs with 24 unique dual barcodes (unique i5 and i7 indexes) for library multiplexi…	24 rxns
C05010043	CATS mRNA-seq Kit (with polyA selection) v2 x24 An updated version of this kit using D-Plex technology is available for superior performance. Discover our NEW D-Plex mRNA-seq Kit for Illumina.	24 rxns
C05010041	CATS RNA-seq Kit v2 x24 An updated version of this kit using D-Plex technology is available for superior performance. Discover our NEW D-Plex Total RNA-seq Kit for I…	24 rxns
C05010040	CATS Small RNA-seq Kit x24 An updated version of this kit using D-Plex technology is available for superior performance. Discover our NEW D-Plex Small RNA-seq Kit for Illumi…	24 rxns
C05010042	CATS Total RNA-seq Kit (with rRNA depletion) v2 x24 An updated version of this kit using D-Plex technology is available for superior performance. Discover our NEW D-Plex Total RNA-seq Kit for I…	24 rxns
C05030032	D-Plex mRNA Capture Module Diagenode’s D-Plex mRNA Capture Module is based on oligo d(T) magnetic beads to select only poly(A)-tailed RNAs such as mRNAs and some lncRNAs. This me…	24 rxns

MGI Sequencing Platforms

Code	Description	Format
C05030060	D-Plex DNBSEQ Barcodes for MGI Sequencing – Set A D-Plex DNBSEQ Barcodes – Set A includes primers with 24 barcodes to enable multiplexing with the D-Plex Small RNA DNBSEQTM Kit. …	24 rxns
C05030061	D-Plex DNBSEQ Barcodes for MGI Sequencing – Set B D-Plex DNBSEQ Barcodes – Set B includes primers with 24 barcodes to enable multiplexing with the D-Plex Small RNA…	24 rxns
C05030051	D-Plex Small RNA DNBSEQ™ Kit for MGI Sequencing Download the manual D-Plex Small RNA DNBSEQ™ Kit is a tool designed for the study of the small non-coding transcriptome. The kit is using the D-…	24 rxns