ATAC-seq package for tissue
ATAC-seq, Assay for Transposase-Accessible Chromatin, seguito dal sequenziamento NGS, è una tecnologia chiave per la mappatura dell’intero genoma della cromatina accessibile. La tecnologia si basa sull’uso della trasposasi Tn5 che taglia la cromatina aperta esposta e lega contemporaneamente gli adattatori per la successiva amplificazione e sequenziamento.
Il kit ATAC-seq package for tissue di Diagenode si basa su un protocollo altamente convalidato ottimizzato campioni di tessuto cpmpresi tra i 25 e i 100 mg per reazione. Il protocollo è stato convalidato su molti tessuti diversi di mammiferi (polmone, fegato, cervello, rene, muscoli) e diverse specie (maiale, pollo, ratto, topi, cavallo). Il pacchetto include i reagenti per il flusso di lavoro ATAC-seq completo, tra cui estrazione dei nuclei, preparazione della libreria e multiplexing.
Contenuto del Kit ATAC-seq package for tissue
- Estrazione di nuclei tissutali per ATAC-seq: protocollo e reagenti ottimizzati per un isolamento altamente efficiente dei nuclei dai tessuti, preservando i nuclei
- Kit ATAC-seq: generazione di librerie di alta qualità
- 8 UDI per librerie taggate*: multiplexing efficiente che consente l’identificazione e il filtraggio con index hopping.
Caratteristiche
- Soluzione completa per il flusso di lavoro ATAC-seq
- Estrazione di nuclei altamente efficiente dal tessuto
- Validato su molti tessuti di mammiferi
- Compatibile con le piattaforme di sequenziamento Illumina
*Per il multiplexing delle librerie, il pacchetto ATAC-seq 8 rxns include il kit 8 UDI per librerie taggate, Cat. N. C01011035. Se necessario, è possibile un multiplexing più elevato utilizzando altri set di indici Primer per librerie taggate, disponibili separatamente.
the project GENE-SWitCH leading to this application has received funding from the European Union’s Horizon 2020 research and innovation programme under the grant agreement No 817998.
| # | Codice Prodotto | Descrizione | Formato |
|---|---|---|---|
| 1 | C01080006 | ATAC-seq package for tissue | 24 rxns |
| 2 | C01080005 | ATAC-seq package for tissue | 8 rxns |
Solizioni addizionali per ATAC-seq
Primer indexes for tagmented libraries:
- 24 SI for Tagmented libraries Cat. No. C01011032
- 8 SI for Tagmented libraries Cat. No. C01011033
- 24 UDI for Tagmented libraries – Set I, Cat. No. C0101134
- 8 UDI for Tagmented libraries, Cat. No. C0101135
- 24 UDI for Tagmented libraries – Set II, Cat. No. C0101136
- 24 UDI for Tagmented libraries – Set III, Cat. No. C0101137
Magnetic rack: DiaMag 0.2 ml – Cat. No. B04000001
Additional supplies (included in the kit and available separately):
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