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OneArray® Rat Microarray

ROA Caratteristiche:

  • 24,358 sonde genoma di ratto e 980 sonde controlli
  • Sonde polinucleotidiche altamente sensibili 60-mer sense-strand
  • Formato slide standard 1″ X 3″ (25mm x 75mm)
  • Eccellente riproducibilità dati con CV<4%
  • Elevata correlazione con Real Time PCR
  • Ogni sonda è spottata sull’array in maniera efficace tramite una tecnologia innovativa “non-contact” adattata e perfezionata per la fabbricazione dei microarray.

ROA_001 Rat Whole Genome OneArray® Microarray, 10 arrays

Rat OneArray® Probe Set Content
Probe Type Number of Probes
Total Probes 25,338 (total)
Content Probes

  • RefSeq release 42
  • Ensembl release 59
19,247

5,111

Control Probes 980
Rat OneArray® Performance

La tabella accanto mostra i risultati ottenuti utilizzando 5 Rat OneArray DNA Microarrays.

2.5 ug di Brain Reference total RNA (Ambion) sono stai amplificati utilizzando Amino Allyl MessageAmp™ Kit (Ambion). Per l’ibridazione, 10 ug di aRNA sono stati marcati con Cy5,e analizzati con uno scanner Agilent*.

*Axon scanner settings:
PMT / Power: 600/100;
Filter: F635.Median – B635.Mean >2.6 B635 sd.

Rat OneArray® Whole Genome Hybridization
Spot Number Spot Percentage Average Signal Intensity
Average Value 18722 76.9% 2547
CV 3.25% 3.25% 3.9%
Correlazione con Real Time PCR

Per confermare le performance OneArray, i dati ottenuti con rat microarray sono stati validati in qPCR su campioni di Riferimento Unversali e campioni Brain RNA. 40 geni sono stati selezionati in maniera random dal range di detection lineare del microarray dataset e confrontati con i risultati di qPCR. E’ stata verificata un eccellente correlazione alla qPCR (R = 0.978) , offrendo una forte sicurezza di elevata fedeltà nei vostri studi microarray.

ROA_qPCR




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