Normalmente non sono richieste modificazioni chimiche sui siRNA, ma talvolta alcune posso risultare molto utili e.g. per aumentare la stabilità o l’uptake cellulare. Lo strand antisenso deve avere sia un 5’-OH (by default) libero o un terminale 5’-phosphate. Le modifiche al 5’-end dello strand senso RNA non alterano l’efficienza del silenziamento. Varie dyes fluorescenti possono essere coniugate all’estremità 5’ dello strand senso per monitorare l’efficienza di transfezione del corrispondente duplex. Inoltre modificare il siRNA con il colesterolo è utile per facilitare l’uptake cellulare / tissutale.

Sono disponibili anche modifiche come 2’O-methyl RNA, legami fosforotioati, LNA® e una varietà di altre opzioni.

Come conseguenza, Eurogentec è in continua estensione della propria lista di modificazioni disponibili. Le modifiche presenti qui di seguito sono valide per i siRNA e rientrano nel catalogo modifiche per il sevizio di Sintesi Oligunucelotidi Custom

Amino Modifier disponibili in diverse scale si sintesi

	3′ Amino Modifier C6 5′ Amino Modifier C3 5′ Amino Modifier C6 5′ Amino Modifier C12
Amino d(R)	C6-dT, dU, Propargyl-dU and Propargylcaproyl-dU

Alexa Fluor® dyes disponibili in diverse scale si sintesi

5′ Alexa 350 5′ Alexa 430 5′ Alexa 488 5′ Alexa 500 5′ Alexa 514 5′ Alexa 532 5′ Alexa 546 5′ Alexa 555 5′ Alexa 568 5′ Alexa 594 5′ Alexa 610 5′ Alexa 633 5′ Alexa 647 5′ Alexa 660 5′ Alexa 680 5′ Alexa 700 5′ Alexa 750

Colesterolo disponibili in diverse scale si sintesi

3′ TEG Cholesteryl 5′ TEG Cholesteryl Cholesteryl d(R)

Cy® dyes disponibili in diverse scale si sintesi. Modifiche al 5′ a al 3′

• Cy®3 e Cy®3.5
  • assorbanza nell’arancione con elevati quantum yealds, elevato coefficiente d’estinzione e buona stabilità del segnale fluorescente anche al variare del pH in diverse condizioni di buffer
• Cy®5
  • assorbanza nel rosso con elevati quantum yealds, elevato coefficiente d’estinzione e buona stabilità del segnale fluorescente in diverse condizioni di buffer
• Cy®5.5
  • assorbanza nel rosso lontano con elevati quantum yealds, elevato coefficiente d’estinzione e buona stabilità del segnale fluorescente in diverse condizioni di buffer

ATTO-TEC dyes disponibili in diverse scale si sintesi.

ATTO-TEC dyes possono essere utilizzate come marcatori fluorescenti per un’ elevata varietà di biomolecole compresi gli oligonucleotidi. ATTO dyes coprono la regione dello spettro che va da 350 nm in the UV fino a 750 nm in nel vicino infrarosso.

FAM disponibili in diverse scale si sintesi.

3′ 6-FAM 5′ 6-FAM 6-FAM d(R) 6-FAM d(T)

HEX disponibili in diverse scale si sintesi.

5′ HEX HEX d(R) HEX d(T)

Fosfato disponibili in diverse scale si sintesi.

5′ Phosphate 3′ Phosphate

TET disponibili in diverse scale si sintesi.

5′ TET TET d(R) TET d(T)

TAMRA disponibili in diverse scale si sintesi.

3′ TAMRA 5′ TAMRA TAMRA d(T)