Biosense | Scorpions

Scorpions

Sonde Scorpions per PCR quantitativa Real Time e genotipizzazione. Utilizzabili anche in analisi end-point

Gli Scorpions^® sono primers di PCR con una coda “stem-loop” che contiene un fluoroforo e un quencher. La coda “stem-loop” è separate dalla sequenza del primer di PCR da un “PCR blocker”, una modificazione chimica che impedisce alla Taq DNA polymerase di copiare la sequenza dello Scorpions^®. Questo impedisce l’apertura non specifica del loop che porterebbe all’emissione di fluorescenza aspecifica. Gli Scorpions^® differiscono dalle metodiche di detetion tradizionali dal momento che i loro meccanismo di “probing” è intramolecolare. Durante la PCR, i primers Scorpions^® vengono allungati per produrre prodotti di PCR. Durante la fase di annealing la sequenza sonda nella coda dello Scorpion scivola indietro per ibridizzare con la sequenza target contenuta nel prodotto di PCR neoformato. Dal momento che la coda dello Scorpions^®e il prodotto di PCR sono ora parte dello stesso strand, l’interazione è intramolecolare, cineticamente favorevole e altamente efficiente.

Eurogentec propone tre tipologie di sonde Scorpions®: Standard Scorpions^®, FRET Scorpions^®, and Duplex Scorpions^®.

Standard Scorpions^®

Consiste di una sonda bi-marcata con una dye fluorescente all’estremità 5’ (FAM, HEX, TET, JOE, Yakima Yellow®, ROX, …) e un quencher non fluorescente interno. Scala di sintesi 200 nmol.

FRET Scorpions^®

FRET Scorpions® 5’ HEX + 3’ DABCYL. Scorpions® utilizzati su strumenti a capillari per la detection nel canale 2 (640 nm). Scala di sintesi 200 nmol.

Duplex Scorpions®

Duplex Scorpions® 5’ TET + 3’ DABCYL. Negli Duplex Scorpions®, il quencher è su un altro oligonucleotide. Scala di sintesi 200 nmol.